变异少女的屠杀，自地球第三次世界大战后，全世界产生了极强的核辐射以及核变异，最后在外星陨石的撞击下，地球上的生物经过两大灾难后，均产生了变异。

其中许多动植物变异成了体型巨大的怪兽，同时由于三战中，人类大量使用生化武器，以及核武器，最后又经过外星陨石中携带的病毒感染，很多人在死去后又变成了丧尸。

经过战争，怪兽，丧尸的洗礼后，原本八十多亿的人类，如今只剩下了不到四十亿，全球超过一半的人类死去，末世降临。

好在人类中也产生了变异，一些强大的变异体开始组织人类反击，就这样人类挺了过来。之后人类中陆陆续续出现了新的，实力更强的变异体，人类也为这些变异体授予了一个名字，能力者。能力者又按照变异程度不同，能力大小不一样，将其分为了LV1普通能力者，LV2特殊能力者，LV3大能力者，LV4极限能力者，LV5超能力者。

这些能力者，有的天生极强，有的通过后天修炼，最后都成了新世纪人类中的强者。